Гимназия создана на базе СШ № 3, открывшейся в 2004 году. В 2008 году учебное заведение преобразовано в гимназию на основании решения № 620 от 19 августа 2008 г. Верхнедвинского районного исполнительного комитета.
В 2011 году был выдан сертификат № 0003119 о государственной аккредитации на соответствие заявленному виду (получен в соответствии с приказом Министерства образования Республики Беларусь № 846 от 30 декабря 2011 г.).
В 2016 году учебное заведение аккредитовано на соответствие заявленному виду гимназия, выдан сертификат № 0006668 (в соответствии с приказом Министерства образования Республики Беларусь № 268 от 30 марта 2016 г.).
Верхнедвинская гимназия создана в форме учреждения на основе государственной собственности, финансируемого из местного бюджета. Уполномоченным собственником имущества гимназии является город Верхнедвинск. Полномочия учредителя (собственника) осуществляет Верхнедвинский районный исполнительный комитет в лице отдела образования, спорта и туризма.
Верхнедвинская гимназия является юридическим лицом, имеет печать с изображением Государственного герба Республики Беларусь и наименованием Верхнедвинская гимназия и штамп установленного образца с наименованием Верхнедвинская гимназия.
Верхнедвинская гимназия непосредственно подчиняется отделу образования, спорта и туризма, администрации Верхнедвинского районного исполнительного комитета, который осуществляет государственный контроль деятельности Верхнедвинской гимназии.
Решением Витебского областного исполнительного комитета № 13 от 13.01.2005 года государственное учреждение образования "Верхнедвинская гимназия" зарегистрировано в Едином государственном реестре юридических лиц и индивидуальных предпринимателей за № 390352246.
Педагогический коллектив в своей работе руководствуется Кодексом Республики Беларусь об образовании, Положением об учреждении общего среднего образования, утвержденным постановлением Министерства образования Республики Беларусь от 20.12.2011 № 283, Уставом гимназии (регистрационный номер № 390352246 от 26.05.2015) и другими нормативными документами и локальными актами.
Организация образовательного процесса осуществляется на основе соблюдения принципов государственной политики в области образования и на педагогически обоснованном выборе методов и средств обучения и воспитания, определяется соответствующими образовательными стандартами, учебным планом и программами, разработанными и утвержденными в определенном для учреждений образования порядке, в соответствии с требованиями, которые регламентированы Кодексом Республики Беларусь об образовании, санитарными нормами и правилами ”Требования для учреждений общего среднего образования“, утвержденными постановлением Министерства здравоохранения Республики Беларусь от 27.12.2012 № 206, другими действующими нормативными правовыми актами.
В гимназии создаются благоприятные условия для устойчивого развития образовательной системы гимназии, которые гарантируют повышение качества образовательных услуг, развитие интеллектуальных и творческих способностей гимназистов, воспитание социально активной, культурно развитой личности, гражданина-патриота своей страны.